Početkom ožujka inokulirali smo četiri sorte vinove loze različitim izolatima GLRaV-3. Biljke smo individualno zarazili inokulumom koji je sadržavao samo jednu genetičku varijantu GLRaV-3 (monofiletski izolati) i kombinacijom genetskih varijanti (polifiletski izolati). Jedan dio biljaka zaražen je i miješanim virusnim izolatima sastavljenim od GLRaV-3 i ali i drugim virusima koji su najzastupljeniji u dalmatinskim autohtonim sortama vinove loze. Ukupno smo cijepili oko 300 biljaka. Dio biljaka je ostao je neinokuliran i služit će kao kontrolne biljke. Ovaj pokus postavljen je da bi se mogle ispitati biološke karakteristike genetskih varijanti GLRaV-3, njihovih kombinacija i karakteristike poljskih izolata te da bi se razjasnilo ponašanje GLRaV-3 virusa i njegovih varijanti u smislu replikacije u domaćinskim biljkama i odgovora domaćina na virusnu zarazu.
Author Archives: Katarina Hančević
2019 godina bliži se svome kraju, isto kao i prva godina GRAPE-PATH3 projekta. Bila je ovo dobra godina! Naš tim sada je bogatiji za jednog novog člana, doktoranda Matu. Naš laboratorij je opremljen s modernim i sigurnim UV-sistemom za dokumentaciju gela, ELISA-čitačem te sustavom za vertikalnu elektroforezu. Biljke nam rastu u novo-servisiranoj vegetacijskoj komori. Imamo rezultate virusne distribucije u autohtonim sortama vinove loze te rezultate populacijske strukture GLRaV-3 virusa. I još puno više.. A najvažnije od svega je da smo uživali stvarajući nove rezultate zajedno!
Sretna Nova godina! Sretno s radom, s novim rezultatima i projektima!
Tim GRAPE-PATH3
Izlaganje na Sabatini
Dr. sc. Katarina Hančević je 08. studenog sudjelovala kao predavač na tradicionalnom 29. međunarodnom susretu vinara i vinogradara Sabatina 2019, u organizaciji Zadružnog saveza Dalmacije, koje se održalo u Segetu Donjem pokraj Trogira.
Izlaganje pod naslovom: “Patogenost virusa vinove loze u autohtonim dalmatinskim sortama” je bilo u sklopu znanstveno-stručnog skupa u organizaciji Agronomskog fakulteta u Zagrebu. Dio izlaganja bio je posvećen prezentaciji HRZZ projekta GRAPE-PATH3.
Dragoj kolegici s Instituta i suradnici na projektu, dr. sc. Ani Mucalo je na Sabatini uručena povelja “Zlatan Plenković” za mladog vinogradarsko-vinarskog stručnjaka koju joj je dodijelio “Zlatan otok” iz Svete Nedjelje. Iako ova zaslužena nagrada nije povezana s projektom, ovom prilikom Ani čestita cijeli GRAPE-PATH3 tim!
Priprema virusnih inolukuma za cijepljenje indikatorskih biljaka
Biljke vinove loze iz kolekcijskog nasada kod kojih smo dokazali prisustvo GLRaV-3 virusa smo ukorijenili i rasadili za potrebe biološkog indeksiranja. Budući da kod ispitivanih loza nismo detektirali sve genetske varijantne GLRaV-3 u samostalnoj infekciji, pojedine monofiletske varijante GLRaV-3 kojima ćemo inficirati indikatorske biljke smo pribavili ljubanošću dr. sc. Rachelle Bester sa fakulteta Stellenbosch (Department of Genetics) iz Južnoafričke Republike. Te reznice čekaju proljeće sljedeće godine kada će biti cijepljene na uzgojene indikatorke biljke.
Reznice Cabernet Sauvignona inficirane genetskim varijantama GLRaV-3 Sorta Plavac mali inficiran samo jednom genetskom varijantom GLRaV-3
Zapažanje simptoma virusne infekcije u nasadu
Paralelno s laboratorijskim analizama genetske raznolikosti GLRaV-3 virusa kojeg smo detektirali u autohtonim sortama, od proljeća pratimo pojavu i intenzitet simptoma svih virusnih oboljenja na lozama u kolekcijskom nasadu. Prve simptome koje smo uočili su bili žućenje i lepezastost listova koji se povezuje s virusima iz skupine infektivne degeneracije. Dolaskom ljeta počeli su se razvijati simptomi crvenila listova između lisnih žila kod loza zaraženih virusima iz skupine virusa uvijenosti listova. S vremenom su ti listovi postajali sve crveniji te su se počeli i uvijati. Upravo zbog tog simptoma virusi uvijenosti listova opravdano nose dano im ime.
Stručno usavršavanje doktoranda Mate Čarije
Mate Čarija je bio na stručnom usavršavanju od 17. 06. do 30.06. 2019. u Institutu za održivu biljnu zaštitu u Bariju u Italiji. Domaćin je bio prof. dr. sc. Pasquale Saldarelli, također suradnik na projektu.
I dok smo mi u Hrvatskoj slavili dva praznika u tom periodu, Mate je u Laboratoriju prof. Saldarellia usvajao Real-time PCR metodu, naprednu analitičku metodu detekcije i kvantifikacije virusa vinove loze. U drugom tjednu boravka u Bariju u Laboratoriju Agritesta Mate je proveo ELISA testiranje autohtonih sorata vinove loze na 8 najznačajnijih virusa.
Interna metodološka radionica
Prisustvovali smo internoj metodološkoj radionici na Prirodoslovno-matematičkom fakultetu u Zagrebu. Na radionici smo se teoretski i praktično upoznali s metodom polimorfizma konformacije jednolančanih DNA-molekula poznatiju pod na nazivom SSCP-metoda koja se koristi za određivanje različitih genetskih varijanti prisutnih u izolatu virusa. Metodu smo koristili kako bi odredili genetske varijante GLRaV.-3 virusa u uzorcima vinove loze. Radionica je trajala 5 dana a vodila ju je dr. sc. Silvija Černi, suradnica na projektu.
Program radionice prilagođavali smo na svakodnevnoj bazi u skladu s usvajanjem protokola za izvođenje SSCP metode te dobivenim rezultatima.
Proizvodnja i priprema biljaka za biološko indeksiranje GLRaV-3
Set bezvirusnih reznica indikatorskih biljaka stavili smo na ukorjenjivanje u svrhu biološke detekcije i karakterizacije GLRaV-3. Indikatorske biljke uključuju sljedeće kultivare vinove loze: Pinot noir, Merlot i Cabernet franc. Reznice autohtone sorte Tribidrag također su ukorijenjene kako bi se nakon inficiranja virusom mogli detektirati i opisati simptomi zaraze GLRaV-3, fiziološke i biokemijske promjene biljke domaćina te dinamika virusne replikacije.
Neke ukorijenjene biljke već su presađene u lonce i smještene u komoru staklenika pod odgovarajućim režimom navodnjavanje, ishrane i zaštite bilja.
Dobiveni prvi rezultati detekcije virusa vinove loze
U Laboratoriju za molekularnu karakterizaciju u Institutu za jadranske kulture i melioraciju krša uveli smo protokol za detekciju virusa vinove loze te smo detektirali 5 virusa koji su uključeni u direktivu EU. Direktiva Europske komisije 2005/43/EC podrazumijeva kompleks infektivne degeneracije (virusa lepezastog lista vinove loze-GFLV, virusa mozaika gušarke loze-ArMV), uvijenosti lista vinove loze (virus uvijenosti lista vinove loze 1-GLFaV-1, virus uvijenosti lista vinove loze 3-GLRaV-3), te virusa pjegavosti vinove loze (GFkV) samo za podloge, uzročnike štetnih bolesti čija se prisutnost mora kontrolirati i ukoliko se evidentiraju u biljkama, one moraju biti isključene iz matičnog nasada nakon provedbe nacionalnih shema certifikacije. Dosada smo evidentirali sve navede viruse u ispitivanim autohnotim sortama vinove loze!
Predavanje na Festivalu znanosti
Mate Čarija, dipl.ing. hort. održao je predavanje pod nazivom „Boje virusa vinove loze“ na Festivalu znanosti u Splitu. Mate je na znanstveno-popularan način govorio o posljedicama koje različiti virusi imaju na vinovu lozu te o načinima prevencije zaraze. Predavanje je održano 10. travnja 2019. u knjižnici Instituta za jadranske kulture i melioraciju krša u Splitu. Predavanje je ujedno bila i prva prezentacija Mate kao suradnika na projektu GRAPE-PATH3. Bilo je to jedno vrlo poučno, zanimljivo i šareno predavanje!
VIše o programu možete naći na linku http://novosti.krs.hr/festival-znanosti-2019/ a cjelovita prezentacija je priložena na kraju ove objave.